Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chl1P70232 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chl1P70232 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms