Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crnkl1P63154 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crnkl1P63154 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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