Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtnP63089 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtnP63089 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PtnP63089 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms