Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smg6P61406 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smg6P61406 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg6P61406 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg6P61406 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms