Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Eif3eP60229 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3eP60229 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms