Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snrpa1P57784 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpa1P57784 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms