Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PitpnbP53811 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PitpnbP53811 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PitpnbP53811 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PitpnbP53811 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PitpnbP53811 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PitpnbP53811 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PitpnbP53811 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PitpnbP53811 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms