Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SftpdP50404 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms