Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc13P50207 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms