Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd1P48410 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms