Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrprbP47758 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrprbP47758 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SrprbP47758 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms