Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf1P46099 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms