Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptpn1P35821 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms