Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grin2aP35436 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms