Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms