Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptk2P34152 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptk2P34152 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms