Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd28P31041 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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