Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vcam1P29533 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms