Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprmP28828 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtprmP28828 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtprmP28828 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms