Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfraP26618 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms