Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxd12P23812 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms