Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RarbP22605 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RarbP22605 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RarbP22605 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RarbP22605 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms