Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ms4a2P20490 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms