Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcaP20444 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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