Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VimP20152 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VimP20152 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VimP20152 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VimP20152 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VimP20152 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VimP20152 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
VimP20152 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VimP20152 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms