Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sptan1P16546 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sptan1P16546 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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