Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lamp1P11438 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms