Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ShdO88834 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ShdO88834 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ShdO88834 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms