Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BlmO88700 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BlmO88700 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BlmO88700 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BlmO88700 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BlmO88700 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BlmO88700 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BlmO88700 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BlmO88700 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BlmO88700 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BlmO88700 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BlmO88700 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BlmO88700 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BlmO88700 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BlmO88700 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BlmO88700 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BlmO88700 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BlmO88700 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BlmO88700 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BlmO88700 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BlmO88700 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BlmO88700 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BlmO88700 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BlmO88700 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BlmO88700 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BlmO88700 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BlmO88700 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BlmO88700 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BlmO88700 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BlmO88700 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BlmO88700 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BlmO88700 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BlmO88700 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BlmO88700 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BlmO88700 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BlmO88700 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BlmO88700 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BlmO88700 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BlmO88700 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BlmO88700 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms