Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Tnnt1O88346 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Tnnt1O88346 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Tnnt1O88346 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Tnnt1O88346 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Tnnt1O88346 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Tnnt1O88346 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Tnnt1O88346 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnt1O88346 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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