Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp1O70373 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp1O70373 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms