Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itgb5O70309 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms