Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TnxbO35452 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms