Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Xbp1O35426 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Xbp1O35426 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms