Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh2d1bO35324 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh2d1bO35324 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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