Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms