Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm8356J3QPD3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm8356J3QPD3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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