Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gm20795J3QP49 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gm20795J3QP49 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gm20795J3QP49 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gm20795J3QP49 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gm20795J3QP49 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Gm20795J3QP49 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Gm20795J3QP49 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Gm20795J3QP49 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Gm20795J3QP49 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm20795J3QP49 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20795J3QP49 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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