Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm17577J3QNF7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms