Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top6blJ3QMY9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Top6blJ3QMY9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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