Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3336J3QMQ6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms