Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tmem200cJ3QK46 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms