Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nccrp1G3X9C2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms