Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28048F7BCN0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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