Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm10378F6XQQ1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm10378F6XQQ1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms