Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms