Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Zfp988F6VKC7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Zfp988F6VKC7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Zfp988F6VKC7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Zfp988F6VKC7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Zfp988F6VKC7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Zfp988F6VKC7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Zfp988F6VKC7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zfp988F6VKC7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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