Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms