Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lmod3E9QA62 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms