Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms